梅雨前線が本州南岸に停滞、オホーツク海高気圧も強く、
梅雨前半の典型的な気圧配置パターンとなっている。
北日本日本海側など一部を除き、全国的に雲が多い。
太平洋側は所々で弱い雨、
関東は朝晩を中心に雨（内陸の多い所で日雨量30ミリ）。
台風5号は00時以降930hPa（猛烈）な勢力だったが、
15時以降は945hPa（非常に強い）となった。
2006年9/17に起きた宮崎・JR日豊線特急電車横転事故で、
国土交通省航空・鉄道事故調査員会は、
風速50メートル以上の竜巻の突風が原因だったと認定。
事故調査員会が事故原因に竜巻を認定したのは初めて。
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最高気温 関東以北の太平洋側で低く、
内陸では平年を大幅に下回る。
仙台12.5℃（平年差－9℃）
銚子14.3℃（同－7℃）
熊谷15.2℃（同－10℃）
水戸15.5℃（同－7℃）
前橋15.6℃（同－10℃）
東京17.1℃（同－7℃）
熊谷は3月下、
仙台、東京は4月上並の気温。
一方、西日本は平年並～高めで、
松江26.6℃は7月上並、
松山27.1℃、鹿児島28.9℃は、
ともに6月下旬並の気温。
最低気温 関東以北の各地では、
平年並～4℃前後低め。
東海、北陸、西日本、
南西諸島では、
平年を2～5℃上回った。
大阪、福岡、那覇は6月中並、
広島、鹿児島22.1℃は6月下並。
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