エルニーニョ現象が発生しているとみられ、冬までは持続する可能性が高い。
インド洋熱帯域の海面水温は、夏の間、基準値に近い値で推移すると予測される。
2009年6月の海面水温(上)と平年偏差(下)
(上)赤：28℃以上 (下)青：平年より低い
2009年6月の状況
6月のエルニーニョ監視海域の海面水温の基準値との差は+0.7℃で 、4月の5か月移動平均値は0.0℃、また、南方振動指数は0.0だった。
6月の太平洋赤道域の海面水温は、ほぼ全域で正偏差だった。海洋表層の水温は、太平洋赤道域のほぼ全域で正偏差だった。
6月の太平洋赤道域の大気下層では、ほぼ全域で西風偏差が見られた。
今後の見通し（2009年7月〜2010年1月）
太平洋赤道域のほぼ全体で暖水の蓄積が見られ 、エルニーニョ現象の初期に見られる海洋の特徴を示していることから、今後、東部の海面水温偏差の上昇が考えられる。
また、エルニーニョ予測モデルは、エルニーニョ監視海域の海面水温の基準値との差が 、秋から冬にかけて上昇する傾向を予測している。
以上のことから、エルニーニョ現象が発生しているとみられ 、冬までは持続する可能性が高いと考えられる。
西太平洋熱帯域の海面水温は、春以降、概ね基準値に近い値で推移した。西部太平洋熱帯域の海面水温は、夏の間は基準値に近い値で推移すると予測される。
インド洋熱帯域の海面水温は、昨秋以降、概ね基準値に近い値で推移した。インド洋熱帯域の海面水温は、夏の間は基準値に近い値で推移すると予測される。
エルニーニョ現象の初期の段階であるため、6月の日本の天候への影響は明瞭ではなかった。今後の日本の天候については、最新の季節予報を参照されたい。
エルニーニョ監視海域：北緯5度〜南緯5度、西経150度〜90度
各監視指数の最近10年間の経過
(1999年1月〜2009年6月)
折線は月平均値、滑らかな太線は5か月移動平均値
赤：エルニーニョ現象 青：ラニーニャ現象 発生期間
気象庁では、エルニーニョ監視海域の海面水温の基準値との差の5か月移動平均値が
6か月以上続けて+0.5℃以上となった場合をエルニーニョ現象、
6か月以上続けて-0.5℃以下となった場合をラニーニャ現象としている。
| 2008年 | 2009年 | |||||||||||
| エルニーニョ監視指数 | 7月 | 8月 | 9月 | 10月 | 11月 | 12月 | 1月 | 2月 | 3月 | 4月 | 5月 | 6月 |
| 基準値との差(℃) | +0.5 | +0.6 | +0.2 | -0.2 | -0.1 | -0.6 | -0.5 | -0.6 | -0.6 | -0.1 | +0.4 | +0.7 |
| 5か月移動平均(℃) | +0.2 | +0.2 | +0.2 | 0.0 | -0.2 | -0.4 | -0.5 | -0.5 | -0.3 | 0.0 | ||
| 南方振動指数 | +0.2 | +1.0 | +1.2 | +1.6 | +1.5 | +1.6 | +0.8 | +1.3 | +0.3 | +0.9 | -0.5 | 0.0 |
資料提供：気象庁
